Den 24-årige svensken gick i mål som ledare med den sensationella tiden 12:32,95, lite mindre än sekunden bättre än det tidigare världsrekordet på 12.33,86.
van der Poel gick i mål med en stor ledning, men flera av favoriterna har inte kört än, bland annat holländarna Patrick Roest och Jorrit Bergsma.
Nils van der Poel tog VM-guld i 5 000 meter i torsdags, Sveriges första i skridsko sedan 1973. Han tangerade samtidigt sitt eget svenska rekord på distansen.
Succésvensken tog en paus från skridskon 2018 och gjorde comeback 2020, sedan dess har han levererat flera världsresultat.