Den 51-årige tidigare skidåkaren tillträdde som förbundskapten för fyra år sedan.
Som tränare för damlandslaget har han och Stefan Thomson skördat stora framgångar.
Bara under senaste OS i februari blev det ett guld, två silver och ett brons till deras adepter.
Men nu skiljs duon åt.
Thomson har precis skrivit på ett nytt avtal över fyra år.
Ingesson väljer att sluta och återgår till jobbet som polis i Piteå.
– Jag lämnar absolut inte med någon smolk i bägare, irritation på förbundet eller annat. Vi har haft ett väldigt bra tränarkollektiv senaste året och jag har trivts med jobbet, säger han.
Polisyrket eller tränare i skidlandslaget.
Alternativen har varit tydliga men svåra att välja bland.
– Jag har varit tjänstledig från polisen i fyra år. Det är en ovanligt lång tid. Nu stod valet mellan att säga upp sig eller gå tillbaka. Jag har en trygghet med anställning på orten och det har vägt upp lite mer i mitt val. Men jag kan fortfarande känna "blev det här rätt?". Det är inte lätt. Det är två fantastiska jobb att välja mellan. Nu får jag sätta mig på kontoret som utredare hos polisen. Det blir en omställning, men jag trivdes väldigt bra med det tidigare.
I dagarna lämnar han jobbet på skidförbundet. Den 2 maj är det polisyrket som gäller.
– Jag håller på att fasa ut mig själv på förbundet.
Främsta upplevelserna?
– När vi vann damstafetten i VM i Seefeld. Det var en stor grej. Sedan är det sätt som Jonna vinner VM-guld ifjol och OS-guld i år individuellt väldigt imponerande. Hur hon har åkt och lyckats ta sprinten till en ny nivå. Det känns bra att ha lyckats hjälpa till att skapa en sådan profil.
Magnus Ingesson är Jonna Sundlings personliga tränare och det kommer han fortsätta att vara tillsammans med Stefan Thomson.
– Jag har pratat med henne och hon vill fortsätta att ha kvar oss som tränare och då får vi lösa det. Vi kör vidare som tidigare. Det blir bara roligt att fortsätta bygga tillsammans med henne. Det kan bli någon dag för mig i Östersund men det ska gå att ordna.
Lisa Vinsa kommer han också att fortsätta träna.
Dottern Lisa Ingesson är aktuell för en plats i Piteå Elit.
– Henne kommer jag också att följa på något hörn, vi får se hur.
Dessutom säger han sig vara beredd att hjälpa till mer om det efterfrågas.
– Jag och Stefan (Thomson) pratas vid flera gånger per dag. Det kommer vi säkert att fortsätta med. Behövs det råd eller tips finns jag tillgänglig. Vårt samarbete avslutas inte bara för att jag har en annan tjänst. Det är lite speciellt att vi har jobbat ihop så länge och har lite olika kunskaper.
Nu när du slutar. Vilka okända historier finns det att berätta?
– Det har alltid funnits saker att ta tag i. Det har inte alltid varit kul, det kan vara tunga saker, men något händer alltid. Det som var i SVT var bara skrap på ytan. Men någon speciell händelse kommer jag inte på nu.
Magnus Ingesson lämnar tränaruppdraget i landslaget med högt huvud.
– Det har varit både uppgångar och sämre tävlingar. Men om vi generellt tittar på medaljer och pallplatser på damsidan så har vi gjort fyra väldigt bra år. Det är jag nöjd med. Jag har fått ett fint avslut.
Anders Högberg och Lars Ljung har likt Stefan Thomson skrivit på för fyra nya år som landslagsledare.