I firandet som följde EM-guldet hemma i Madrid tog Rodri och Morata ton, och sjöng "Gibraltar är spanskt" tillsammans med supportrar.
I tisdags anmälde Gibraltars fotbollsförbund stjärnorna till Uefa för de "extremt provocerande och kränkande” ramsorna. Nu har Uefa tillsatt en utredning som ska avgöra om duon brutit mot Uefas disciplinära regler, skriver BBC.
Om de fälls riskerar Rodri och Morata två matchers avstängning, enligt spanska tidningen Marca.
Gibraltar, på södra spetsen av Spanien, har varit ett brittiskt territorium i mer än 300 år, med en befolkning på cirka 35 000 personer. Spanien har länge krävt att få tillbaka Gibraltar.