Bakom segern låg ett mål var av Mikael Gustavsson och Olle Jonsson.
Segern var Munksund-Skuthamns nionde på de senaste nio matcherna.
Munksund-Skuthamn avgjorde matchen i andra halvlek, efter en mållös första.
Det här betyder att Vittjärv slutar på femte plats, och Munksund-Skuthamn på första plats.