Det betyder att Piteå äntligen bröt sin svit med fyra raka förluster.
Piteå avgjorde matchen i andra halvlek, efter en mållös första.
Piteås målskyttar var Fernanda Da Silva och Madelen Janogy, som gjorde ett mål var.
För Piteå gör resultatet att man nu ligger på nionde plats i tabellen, medan IK Uppsala är på tolfte och sista plats.
Piteå tar sig an Kopparbergs/Göteborg i nästa match borta söndag 27 september 14.00.